MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 78843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TTG	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088900
2	NC_003552	AAG	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
3	NC_003552	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
4	NC_003552	TGGG	2	8	603	610	0 %	25 %	75 %	0 %	20088900
5	NC_003552	GC	3	6	660	665	0 %	0 %	50 %	50 %	20088900
6	NC_003552	TTC	2	6	674	679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
7	NC_003552	TC	4	8	699	706	0 %	50 %	0 %	50 %	20088900
8	NC_003552	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088900
9	NC_003552	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088900
10	NC_003552	CGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
11	NC_003552	CAT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
12	NC_003552	TTC	3	9	890	898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
13	NC_003552	TA	3	6	1012	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	20088900
14	NC_003552	CAT	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
15	NC_003552	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
16	NC_003552	ATG	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
17	NC_003552	CTT	3	9	1147	1155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
18	NC_003552	AAG	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
19	NC_003552	ACA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088900
20	NC_003552	A	6	6	1231	1236	100 %	0 %	0 %	0 %	20088900
21	NC_003552	TTCCT	2	10	1265	1274	0 %	60 %	0 %	40 %	20088900
22	NC_003552	TC	3	6	1339	1344	0 %	50 %	0 %	50 %	20088900
23	NC_003552	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088900
24	NC_003552	AAG	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
25	NC_003552	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
26	NC_003552	ATGA	2	8	1509	1516	50 %	25 %	25 %	0 %	20088900
27	NC_003552	TCA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088901
28	NC_003552	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088901
29	NC_003552	AT	3	6	3410	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	20088901
30	NC_003552	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088901
31	NC_003552	ATAA	2	8	3506	3513	75 %	25 %	0 %	0 %	20088901
32	NC_003552	CT	3	6	3543	3548	0 %	50 %	0 %	50 %	20088901
33	NC_003552	AGT	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088901
34	NC_003552	AAC	2	6	3661	3666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
35	NC_003552	A	7	7	3719	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	20088901
36	NC_003552	ACA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
37	NC_003552	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
38	NC_003552	TAT	2	6	3880	3885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
39	NC_003552	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088902
40	NC_003552	TGGC	2	8	3978	3985	0 %	25 %	50 %	25 %	20088902
41	NC_003552	ATCT	2	8	4029	4036	25 %	50 %	0 %	25 %	20088902
42	NC_003552	TTG	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088902
43	NC_003552	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
44	NC_003552	CAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
45	NC_003552	CTT	2	6	4297	4302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
46	NC_003552	ATC	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
47	NC_003552	CTG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
48	NC_003552	GGT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088902
49	NC_003552	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	20088902
50	NC_003552	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
51	NC_003552	TC	3	6	4652	4657	0 %	50 %	0 %	50 %	20088902
52	NC_003552	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	20088902
53	NC_003552	ATC	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
54	NC_003552	ATGGTA	2	12	4744	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088902
55	NC_003552	AAC	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
56	NC_003552	TAT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
57	NC_003552	CTG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
58	NC_003552	CTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
59	NC_003552	GCT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
60	NC_003552	A	6	6	4887	4892	100 %	0 %	0 %	0 %	20088902
61	NC_003552	TC	3	6	5054	5059	0 %	50 %	0 %	50 %	20088902
62	NC_003552	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088902
63	NC_003552	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
64	NC_003552	AGC	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088902
65	NC_003552	AAG	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
66	NC_003552	AGA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
67	NC_003552	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
68	NC_003552	AT	3	6	7369	7374	50 %	50 %	0 %	0 %	20088903
69	NC_003552	CTTT	2	8	7401	7408	0 %	75 %	0 %	25 %	20088903
70	NC_003552	TGG	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088903
71	NC_003552	CAG	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
72	NC_003552	TC	3	6	7501	7506	0 %	50 %	0 %	50 %	20088903
73	NC_003552	ATTT	2	8	7522	7529	25 %	75 %	0 %	0 %	20088903
74	NC_003552	CTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088903
75	NC_003552	TCA	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088903
76	NC_003552	GTAAA	2	10	7728	7737	60 %	20 %	20 %	0 %	20088903
77	NC_003552	GGA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088903
78	NC_003552	T	6	6	7871	7876	0 %	100 %	0 %	0 %	20088903
79	NC_003552	TC	3	6	7952	7957	0 %	50 %	0 %	50 %	20088903
80	NC_003552	TTG	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
81	NC_003552	TTG	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
82	NC_003552	GCA	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
83	NC_003552	TC	3	6	8111	8116	0 %	50 %	0 %	50 %	20088903
84	NC_003552	GTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
85	NC_003552	ACC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
86	NC_003552	T	6	6	8178	8183	0 %	100 %	0 %	0 %	20088904
87	NC_003552	T	6	6	8224	8229	0 %	100 %	0 %	0 %	20088904
88	NC_003552	AGGA	2	8	8308	8315	50 %	0 %	50 %	0 %	20088904
89	NC_003552	AGG	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088904
90	NC_003552	TCC	2	6	8519	8524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
91	NC_003552	GTT	2	6	8552	8557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088904
92	NC_003552	ACC	2	6	8586	8591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
93	NC_003552	GA	3	6	8617	8622	50 %	0 %	50 %	0 %	20088904
94	NC_003552	CTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
95	NC_003552	GAA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
96	NC_003552	GAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
97	NC_003552	CTC	2	6	8746	8751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
98	NC_003552	TGA	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088904
99	NC_003552	AAC	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088904
100	NC_003552	TCC	2	6	8842	8847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
101	NC_003552	CAG	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
102	NC_003552	TCC	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
103	NC_003552	CAG	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
104	NC_003552	CTT	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
105	NC_003552	TGTA	2	8	9185	9192	25 %	50 %	25 %	0 %	20088904
106	NC_003552	TTC	2	6	9297	9302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
107	NC_003552	TCC	2	6	9359	9364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
108	NC_003552	ATGA	2	8	9571	9578	50 %	25 %	25 %	0 %	20088905
109	NC_003552	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
110	NC_003552	ATT	2	6	9641	9646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088905
111	NC_003552	AGG	2	6	9767	9772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
112	NC_003552	TAC	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088905
113	NC_003552	AGG	2	6	9867	9872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
114	NC_003552	A	7	7	9927	9933	100 %	0 %	0 %	0 %	20088905
115	NC_003552	TTTC	2	8	9980	9987	0 %	75 %	0 %	25 %	20088905
116	NC_003552	ATG	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088905
117	NC_003552	AGAT	2	8	10133	10140	50 %	25 %	25 %	0 %	20088905
118	NC_003552	TTCCT	2	10	10220	10229	0 %	60 %	0 %	40 %	20088905
119	NC_003552	CTTC	2	8	10343	10350	0 %	50 %	0 %	50 %	20088905
120	NC_003552	AAG	2	6	10416	10421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
121	NC_003552	AGAA	2	8	10480	10487	75 %	0 %	25 %	0 %	20088905
122	NC_003552	TGCA	2	8	10498	10505	25 %	25 %	25 %	25 %	20088905
123	NC_003552	ATA	2	6	10694	10699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088905
124	NC_003552	AAG	2	6	10736	10741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
125	NC_003552	TTTAT	2	10	11351	11360	20 %	80 %	0 %	0 %	20088906
126	NC_003552	CTTTT	2	10	11417	11426	0 %	80 %	0 %	20 %	20088906
127	NC_003552	CAAT	2	8	11456	11463	50 %	25 %	0 %	25 %	20088906
128	NC_003552	GGA	2	6	11632	11637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088906
129	NC_003552	TTC	2	6	11640	11645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088906
130	NC_003552	AT	3	6	11740	11745	50 %	50 %	0 %	0 %	20088906
131	NC_003552	AT	3	6	11748	11753	50 %	50 %	0 %	0 %	20088906
132	NC_003552	CTG	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
133	NC_003552	ATGG	2	8	11863	11870	25 %	25 %	50 %	0 %	20088906
134	NC_003552	AGA	2	6	11899	11904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088906
135	NC_003552	T	6	6	11950	11955	0 %	100 %	0 %	0 %	20088906
136	NC_003552	CTG	2	6	11962	11967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
137	NC_003552	CT	3	6	12014	12019	0 %	50 %	0 %	50 %	20088906
138	NC_003552	A	6	6	12105	12110	100 %	0 %	0 %	0 %	20088906
139	NC_003552	TGA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
140	NC_003552	GTA	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
141	NC_003552	ATATC	2	10	12296	12305	40 %	40 %	0 %	20 %	20088906
142	NC_003552	TCAGA	2	10	12440	12449	40 %	20 %	20 %	20 %	20088906
143	NC_003552	TTC	2	6	13180	13185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088907
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146	NC_003552	TGAAG	2	10	13249	13258	40 %	20 %	40 %	0 %	20088907
147	NC_003552	TGGA	2	8	13347	13354	25 %	25 %	50 %	0 %	20088907
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159	NC_003552	TTG	2	6	14118	14123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088907
160	NC_003552	T	7	7	14139	14145	0 %	100 %	0 %	0 %	20088907
161	NC_003552	TGG	2	6	14198	14203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088907
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168	NC_003552	ATG	2	6	14504	14509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088907
169	NC_003552	TCT	2	6	14536	14541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088907
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261	NC_003552	CTT	2	6	20593	20598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
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269	NC_003552	CTT	2	6	20941	20946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
270	NC_003552	CTTTT	2	10	20953	20962	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
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